Секвинатор del tamaño de un pendrive
USB-secuenciador de adn simplifica radicalmente el desciframiento del genoma en todas las etapas de la – de la preparación de la muestra del adn antes de obtener el resultado (foto Oxford Nanopore Technologies).
En el reino unido creó el más pequeño de aire rasshifrovshchik del genoma en el mundo. Él aparece en los mostradores en el transcurso de este año, y con una etiqueta de precio bastante atractivo. A la compañíaserá de no menos interesante es el adn-el analizador, preso en el servidor.
La empresa Oxford Nanopore Technologies ha presentado miniatura único determinante de las secuencias de las bases en la molécula de adn á s MinION.
Completamente fuera de línea приборчик, de tamaño un poco más grande de memoria usb, se conecta al puerto USB de su portátil o pc. Contiene todos los elementos necesarios para completar la secuenciación del genoma: микропотоковые sistema único sensor y especializada en el área de la electrónica.
Precisión novato – en el nivel de los actuales sistemas de secuenciación, afirman los creadores de la unidad (foto Oxford Nanopore Technologies). el Aparato produce la lectura directa letras» el adn y en tiempo real refleja en la pantalla, y se escribe en la memoria del equipo.
Los investigadores pueden determinar de antemano qué cantidad de información que les es necesario para los objetivos de esta o de otra índole, o cualquier fragmento de código genético que está buscando, y dejar el desciframiento inmediato de lograr el resultado, para ir rápidamente a un nuevo experimento.
La preparación de las muestras para el sistema de MinION, también, que no requiere de grandes esfuerzos. El aparato funciona con двухцепочечной de adn, y no es necesario amplificación.
En algunos casos, el sensor puede seleccionar la molécula de inmediato de las muestras de sangre o suero, y en ocasiones se puede necesitar una pequeña pre-procesamiento de la mezcla.
Aún más interesante que el MinION es un proyecto que nace con la creación de la más grande y potente que en europa el sistema de secuenciación á s GridION. Ambas utilizan una tecnología de descodificación del genoma, sobre el que un grupo de bioquímicos de la gran bretaña y de los estados unidos trabajó alrededor de 20 años (contando desde la aparición desnuda de ideas).
En el marco del mecanismo de est rog con una función de нанопорами. Esta parte de la unidad obtenida por la combinación naturales (proteínas) y sintéticos de las moléculas.
Нанопоры en la membrana están diseñados para permitir que determinadas moléculas (ilustración de Oxford Nanopore Technologies). Especialmente diseñado enzima que se agrega a una solución de la muestra, recoge la molécula de adn y coherente продавливает a través de su época, como a través de mueren (ver imagen arriba).
En este momento conectada a un poro de circuito electrónico de captura elevalunas fluctuaciones. Por su particular perfil aparato calcula cada pasada básica de un par, y con la alta precisión, incluso para los muy largos fragmentos de la las moléculas de la vida».
Las proteínas нанопора en la membrana. A través de ella va la corriente de iones, en el que se producen los «cortes», que varían en función del tipo de los que pasan a través de estos puerta» las moléculas. Por el grado de desviación de la corriente electrónica identifica básicos de las bases del adn (figura Oxford Nanopore Technologies).
A diferencia de su minsculo compañero sistema GridION es algo así como un complejo de servidores-decodificador (la empresa se llama nodos á s GridION node). Cada nodo tiene una ranura para un solo cartucho. La reserva contiene todo el conjunto de reactivos necesarios para un completo análisis de adn, y en realidad el chip-analizador de dos mil descritas anteriormente нанопор. El nodo GridION node con la alta precisión que mide la unión de los iones de las corrientes en el interior del chip, se descifra y muestra en pantalla el resultado de la secuenciación. En paralelo a la secuencia del código genético se graba en un disco duro externo u otro equipo (a través de USB o de la Red).
Por la noche un GridION node es capaz de emitir decenas de gigabytes de datos de secuencias de adn estudiados.
El aparato GridION puede ser configurado para buscar no sólo en la muestra y el análisis de adn, pero y otras moléculas – los científicos de proteínas o, por ejemplo, explosivos, compuestos (ilustración de Oxford Nanopore Technologies).
A pesar de la servidor» GridION node es capaz de trabajar como independiente en el equipo de sobremesa, más impresionante resultado se logra cuando varios de estos aparatos, que se combinan en armarios rack (ancho estándar de 19 pulgadas) y actúan de forma coherente, el intercambio de datos directamente en la decodificación. (Por cierto, las dimensiones y los conectores GridION node corresponden a la normal del servidor.)
Los cartuchos de tinta para GridION (fotos Oxford Nanopore Technologies). En el año 2013 debe salir la versión GridION node ya en 8000 нанопор, y que debe trabajar más rápido del anterior modelo. De la información de los desarrolladores, de 20 de estas máquinas en un servidor de bastidor capaces de decodificar el genoma completo de una persona en sólo 15 minutos. Ambos aparatos, y GridION (en la primera versión), y la sorprendente MinION, está previsto lanzar al mercado en 2012.
El fabricante tiene la intención de establecer precios competitivos, en comparación con las últimas tecnologías de alta velocidad de descifrado del genoma. En particular, la el secuenciador de adn á s bien» va a costar menos de $900, pasa Technology Review.
«Servidor» GridION node y el conjunto de tales sitios en el servidor de recepción. Una GridION node consume menos de 50 vatios de potencia, destaca la compañía es uno de los beneficios de la máquina (ilustración Oxford Nanopore Technologies). Aquí hay que recordar que hace poco más un año la empresa estadounidense Life Technologies ha presentado ping personal rasshifrovshchik del genoma Personal Genome Machine, que está a menos de $100 mil.
El principio aplicado en el mismo, es diferente de la tecnología GridION, pero hay un rasgo común: para realizar la secuenciación de los científicos también han desarrollado un microchip, que combina la electrónica con la química. En enero de 2012, Life Technologies (o, mejor dicho, su filial la empresa Ion Torrent) mostró su nuevo modelo del decodificador del genoma bajo el nombre de Ion Proton.
Esta máquina valorada ya en $149 mil, pero el chip es un analizador, escondido dentro de 1000 veces más potente que el anterior ejemplo.
El aparato Ion Proton es capaz de leer el genoma completo de la persona en un día cuando el costo de la insumos» $1 mil (foto Ion Torrent Systems/Life Tec hnologies). Todos los aparatos deben resolver el problema, como dicen los científicos, uno de los cuellos de botella en toda la serie de investigación médica y biológica – lento de la decodificación del genoma.
Ahora esa tarea pueden asumir relativamente pequeños de laboratorio, y en el caso de расшифровщиком-drives se puede decir que la tecnología de decodificación de adn se encuentra en el umbral, para llegar casi en cada casa, al igual que ahora la gente se analizan de forma independiente el contenido de azúcar en la sangre.
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